C.E.P.S. : an efficient tool for cardiac electrophysiology simulations

Mehdi Juhoor 1 Yves Coudière 1, 2 Nejib Zemzemi 1
1 CARMEN - Modélisation et calculs pour l'électrophysiologie cardiaque
IMB - Institut de Mathématiques de Bordeaux, Inria Bordeaux - Sud-Ouest, IHU-LIRYC
Résumé : Les modèles numériques sont un outil nouveau et important pour la compréhension des mécanismes des arythmies cardiaques, fournissant des expériences in-silico de plus en plus précises. Au-delà du développement de modèles mathématiques et d'algorithmes numériques, un logiciel doit être développé pour soutenir cette recherche. C.E.P.S. (Cardiac ElectroPhysiology Simulator ) est un outil logiciel en cours de développement par l'équipe-projet Inria Carmen. Son but est de fournir aux chercheurs du groupe de modélisation et ses collaborateurs avec un environnement commun pour développer de nouveaux modèles et méthodes numériques efficaces pour l'électrophysiologie cardiaque. CEPS est conçu pour fonctionner sur les architectures massivement parallèles, et utilise des bibliothèques de calcul bien connues pour réaliser des simulations cardiaques réalistes et complexes. Nos objectifs à court terme comprennent la résolution des équations monodomaine et bidomaine sur le domaine 3D représentant les grandes structures du cœur (ventricules , oreillettes et réseau de conduction cardique). CEPS prend en charge les éléments de couplage surface / volume, surface / câble et volume / câble afin d'y inclure la structure complète du cœur. CEPS est également conçu pour simuler les électrocardiogrammes suivants le couplage coeur / torse . Nous visons également à incorporer automatiquement des modèles ioniques des bases de données de CellML ou JSIM. La structure du code permet d'inclure facilement de nouvelles EDP / systèmes d'EDO.
Type de document :
Poster
Workshop LIRYC, Oct 2013, Bordeaux, France
Liste complète des métadonnées

https://hal.inria.fr/hal-00925834
Contributeur : Mehdi Juhoor <>
Soumis le : mercredi 8 janvier 2014 - 16:24:32
Dernière modification le : jeudi 15 mars 2018 - 22:16:03
Document(s) archivé(s) le : jeudi 10 avril 2014 - 14:25:55

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  • HAL Id : hal-00925834, version 1

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Mehdi Juhoor, Yves Coudière, Nejib Zemzemi. C.E.P.S. : an efficient tool for cardiac electrophysiology simulations. Workshop LIRYC, Oct 2013, Bordeaux, France. 〈hal-00925834〉

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