Les agents sont des programmes autonomes et communicants, conçus pour interagir avec d'autres agents. Dans notre cas les agents sont cognitifs: ils manipulent des connaissances; ces connaissances sont représentées sous forme d'ontologies. Pour communiquer entre eux les agents s'échangent des messages en respectant un formalisme basé sur la théorie des actes de langage. Le langage de communication FIPA-ACL (le plus en vogue actuellement), permet également de spécifier l'ontologie utilisée pour exprimer le contenu du message. Il n'existe cependant pas de formalisme universel propre au contenu sémantique d'un message. Lors d'un échange de messages il convient donc de mettre en rapport les deux ontologies différentes; c'est pour cela qu'a été développée la notion d'alignement, à savoir un ensemble de couples pondérés d'éléments issus de deux ontologies. Sur cette base, notre travail consiste à définir un protocole de communication entre agents qui leur permette de mettre en correspondance leurs ontologies pour pouvoir partager du sens. A cette fin nous intègrerons la notion d'alignement, ainsi que des ressources extérieures dont les agents auront besoin pour manipuler les alignements et optimiser leurs interactions. Enfin, et afin de pouvoir s'intégrer de manière transparente dans un dialogue entre deux agents, le protocole se doit d'être modulaire.