Study of the evolution of symbiosis at the metabolic level using models from game theory and economics

Résumé : Le terme symbiose recouvre tous types d'interactions entre espèces et peut être défini comme une association étroite d'espèces différentes vivant ensemble. De telles interactions impliquant des micro-organismes présentent un intérêt particulier pour l'agriculture, la santé, et les questions environnementales. Tous les types d'interactions entre espèces tels que le mutualisme, le commensalisme, et la compétition, sont omniprésents dans la nature et impliquent souvent le métabolisme. La libération de métabolites par des organismes dans l'environnement permet à d'autres individus de la même espèce ou de différentes espèces de les récupérer pour leur usage propre. Dans cette thèse, nous étudions comment les interactions entre espèces façonnentl'environnement. Nous examinons les questions de (i) quels sont les besoins minimaux en éléments nutritifs pour établir la croissance, et (ii) quels métabolites peuvent être échangés entre un organisme et son environnement. L'énumération de tous les ensembles minimaux stoechiométriques de précurseurs et de tous les ensembles minimaux de métabolites échangés,en utilisant des modèles complets de réseaux métaboliques, fournit un meilleur aperçu des interactions entre les espèces. Dans un environnement spatialement homogène, les métabolites qui sont libérés dans un tel environnement sont partagés par tous les individus. Le problème qui se pose alors est de savoir comment les tricheurs, les individus qui profitent des métabolites libérés sans contribuer au bien public, peuvent être exclus de la population. Ceci et d'autres configurations ont déjà été modélisées avec des approches de la théorie des jeux et de l'économie. Nous examinons comment les concepts d'ensembles minimaux de précurseurs stoechiométriques et d'ensembles minimaux de composés échangés peuvent être introduits dans ces modèles
Type de document :
Thèse
Quantitative Methods [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2016. English. 〈NNT : 2016LYSE1094〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [159 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal.inria.fr/tel-01394107
Contributeur : Abes Star <>
Soumis le : mardi 22 novembre 2016 - 09:25:09
Dernière modification le : jeudi 28 juin 2018 - 14:35:26
Document(s) archivé(s) le : mardi 21 mars 2017 - 10:21:55

Fichier

TH2016WANNAGATMARTIN.pdf
Version validée par le jury (STAR)

Identifiants

  • HAL Id : tel-01394107, version 2

Collections

Citation

Martin Wannagat. Study of the evolution of symbiosis at the metabolic level using models from game theory and economics. Quantitative Methods [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2016. English. 〈NNT : 2016LYSE1094〉. 〈tel-01394107v2〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

501

Téléchargements de fichiers

283